一番の違いは 雇用関係と指揮命令関係の所在

人材派遣の場合は、雇用関係は派遣会社と労働者との間で結ばれます。

仕事の指示は派遣先企業がおこないます。
業務請負では、人材派遣と違い取引先と労働者の間に指揮命令関係が生じません。